La Communauté urbaine de Dunkerque est la première collectivité française à avoir mis en place un centre de tri sélectif des déchets. Fière de cette tradition respectueuse de l'environnement, la collectivité poursuit dans la direction d'une gestion des déchets à la pointe.
Pour compléter le centre de tri, la Communauté exploite 4 déchèteries réparties sur le territoire de l'agglomération. Depuis juillet 2008, les déchèteries de Petite-Synthe, Rosendaël et Bray-Dunes accueillent également les déchets d'équipements électriques et électroniques (DEE) pour les dépolluer, les ré-employer, les recycler ou les valoriser.
La Communauté urbaine a également mis en place, un centre de valorisation organique (CVO) où les déchets fermentescibles de la poubelle verte se transforment en compost. 9 000 tonnes de compost sont ainsi produits à l’année. Dans le même ordre d'idée, la CUD encourage le compostage à domicile, et distribue peu à peu et après une petite formation, des composteurs dans les foyers qui en font la demande.
En janvier 2008 était inauguré un centre de valorisation énergétique (CVE), véritable pôle d’incinération des déchets non-recyclables de la poubelle marron qui les transforme ensuite en énergie pour produire de l’électricité.
Enfin, la CUD souhaite réactiver sa politique déchets dans le cadre de la Charte des déchets : ce document sert de référence pour la politique de gestion des déchets et se décline en 27 actions concrètes (élaboration du guide du tri, actions de communications en faveur du tri et de la réduction des déchets...)